Tracing and Perturbing Human Cell Fates in Organoids - NCCR MSE

Tracing and Perturbing Human Cell Fates in Organoids

Publications

F. Zenk, J. S. Fleck, S. M. J. Jansen, B. Kashanian, B. Eisinger, M. Santel, J. S. Dupre, J. G. Camp, B. Treutlein “Single-cell epigenomic reconstruction of developmental trajectories from pluripotency in human neural organoid systems“ Nat. Neurosci. 2024. [DOI]
S. Ahn, A. Jain, K. C. Kasuba, M. Seimiya, R. Okamoto, B. Treutlein, D. J. Muller, D. J. Müller “Engineering fibronectin-templated multi-component fibrillar extracellular matrices to modulate tissue-specific cell response“ Biomaterials 2024. [DOI]
C. Li, J. S. Fleck, C. Martins-Costa, T. R. Burkard, J. Themann, M. Stuempflen, A. M. Peer, A. Vertesy, J. B. Littleboy, C. Esk, U. Elling, G. Kasprian, N. S. Corsini, B. Treutlein, J. A. Knoblich “Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism“ Nature 2023. [DOI]
J. S. Fleck, J. G. Camp, B. Treutlein “What is a cell type?“ Science 2023. [DOI]
J. S. Fleck, S. M. J. Jansen, D. Wollny, F. Zenk, M. Seimiya, A. Jain, R. Okamoto, M. Santel, Z. He, J. G. Camp, B. Treutlein “Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids“ Nature 2022. [DOI]
T. Gerber, C. Loureiro, N. Schramma, S. Chen, A. Jain, A. Weber, A. Weigert, M. Santel, K. Alim, B. Treutlein, J. G. Camp “Spatial transcriptomic and single-nucleus analysis reveals heterogeneity in a gigantic single-celled syncytium“ eLife 2022. [DOI]
Z. He, A. Maynard, A. Jain, T. Gerber, R. Petri, H. Lin, M. Santel, K. Ly, J. Dupré, L. Sidow, F. Sanchis Calleja, S. M. J. Jansen, S. Riesenberg, J. G. Camp, B. Treutlein “Lineage recording in human cerebral organoids“ Nat. Methods 2022. [DOI]
G. Born, M. Nikolova, A. Scherberich, B. Treutlein, A. García-García, I. Martin “Engineering of fully humanized and vascularized 3D bone marrow niches sustaining undifferentiated human cord blood hematopoietic stem and progenitor cells“ J. Tissue Eng. 2021. [DOI]
H. Lin, Z. He, S. Ebert, M. Schörnig, M. Santel, M. T. Nikolova, A. Weigert, W. Hevers, N. N. Kasri, E. Taverna, J. G. Camp, B. Treutlein “NGN2 induces diverse neuron types from human pluripotency“ Stem Cell Rep. 2021. [DOI]
Q. Yu, U. Kilik, E. M. Holloway, Y. Tsai, C. Harmel, J. H. Wu, M. Czerwinski, C. J. Childs, Z. He, M. M. Capeling, S. Huang, I. A. Glass, P. D. R. Higgins, B. Treutlein, J. R. Spence, J. G. Camp “Charting human development using a multi-endodermal organ atlas and organoid models“ Cell 2021. [DOI]
J. S. Fleck, F. Sanchís-Calleja, Z. He, M. Santel, M. J. Boyle, J. G. Camp, B. Treutlein “Resolving Organoid Brain Region Identities by Mapping Single-Cell Genomic Data to Reference Atlases“ Cell Stem Cell 2021. [DOI]
G. Brancati, B. Treutlein, J. G. Camp “Resolving Neurodevelopmental and Vision Disorders Using Organoid Single-Cell Multi-omics“ Neuron 2020. [DOI]

Project Leader

Barbara Treutlein

Lab

Treutlein group @D-BSSE