Tracing and Perturbing Human Cell Fates in Organoids - NCCR MSE

Tracing and Perturbing Human Cell Fates in Organoids

Publications

B. Treutlein “What is a cell type?“ Science 2023. [DOI]
J. S. Fleck, S. M. J. Jansen, D. Wollny, F. Zenk, M. Seimiya, A. Jain, R. Okamoto, M. Santel, Z. He, J. G. Camp, B. Treutlein “Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids“ Nature 2022. [DOI]
T. Gerber, C. Loureiro, N. Schramma, S. Chen, A. Jain, A. Weber, A. Weigert, M. Santel, K. Alim, B. Treutlein, J. G. Camp “Spatial transcriptomic and single-nucleus analysis reveals heterogeneity in a gigantic single-celled syncytium“ eLife 2022. [DOI]
Z. He, A. Maynard, A. Jain, T. Gerber, R. Petri, H. Lin, M. Santel, K. Ly, J. Dupré, L. Sidow, F. Sanchis Calleja, S. M. J. Jansen, S. Riesenberg, J. G. Camp, B. Treutlein “Lineage recording in human cerebral organoids“ Nat. Methods 2022. [DOI]
G. Born, M. Nikolova, A. Scherberich, B. Treutlein, A. García-García, I. Martin “Engineering of fully humanized and vascularized 3D bone marrow niches sustaining undifferentiated human cord blood hematopoietic stem and progenitor cells“ J. Tissue Eng. 2021. [DOI]
H. Lin, Z. He, S. Ebert, M. Schörnig, M. Santel, M. T. Nikolova, A. Weigert, W. Hevers, N. N. Kasri, E. Taverna, J. G. Camp, B. Treutlein “NGN2 induces diverse neuron types from human pluripotency“ Stem Cell Rep. 2021. [DOI]
Q. Yu, U. Kilik, E. M. Holloway, Y. Tsai, C. Harmel, J. H. Wu, M. Czerwinski, C. J. Childs, Z. He, M. M. Capeling, S. Huang, I. A. Glass, P. D. R. Higgins, B. Treutlein, J. R. Spence, J. G. Camp “Charting human development using a multi-endodermal organ atlas and organoid models“ Cell 2021. [DOI]
J. S. Fleck, F. Sanchís-Calleja, Z. He, M. Santel, M. J. Boyle, J. G. Camp, B. Treutlein “Resolving Organoid Brain Region Identities by Mapping Single-Cell Genomic Data to Reference Atlases“ Cell Stem Cell 2021. [DOI]
G. Brancati, B. Treutlein, J. G. Camp “Resolving Neurodevelopmental and Vision Disorders Using Organoid Single-Cell Multi-omics“ Neuron 2020. [DOI]

Project Leader

Barbara Treutlein

Lab

Treutlein group @D-BSSE